A COVID-19 járvány hatalmas figyelmet irányított az EESZT portálra és kiegészítő rendszereire, mely rengeteg kihívást hozott magával, hiszen korábban nem létező igények funkcionális kielégítésére lett szükség. Így született az oltás időpontfoglaló illetve az oltás adminisztrációs felület is, melyek komplex, a járványügyi helyzethez és az igényekhez folyamatosan alkalmazkodó szolgáltatások. 

Lényeges fejlesztés még az EESZT portáljain működő  adatközlő is, mely lehetővé tette, hogy a kórházak naponta elérhetővé tegyék a különböző erőforrásaikhoz tartozó adatokat, segítve ezzel az Operatív Törzs munkáját. Ugyancsak a járványhelyzet által indukált igények kielégítése kapcsán készült el az eszközrendelő rendszer is, amely felületet biztosít az intézmények védőeszköz-beszerzési folyamatához.